{rfName}
Va

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

70

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Nuñez AAutor o coautorGarcía AmAutor o coautorMoreno DaAutor (correspondència)

Compartir

6 demaig de 2017
Publicacions
>
Article
Sí

Validation of the Hirst-type spore trap for simultaneous monitoring of prokaryotic and eukaryotic biodiversity in urban air samples by NGS.

Publicat a:Applied And Environmental Microbiology. (): e00472-17 - 2017-07-01 (), DOI: 10.1128/AEM.00472-17

Autors: Núñez, A; de Paz, GA; Ferencova, Z; Rastrojo, A; Guantes, R; García, AM; Alcamí, A; Gutiérrez-Bustillo, AM; Moreno, DA

Afiliacions

Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Universidad Autónoma de Madrid (CSIC-UAM), Madrid, Spain. - Autor o coautor
Departamento de Biología Vegetal II, Universidad Complutense de Madrid (UCM), Madrid, Spain. - Autor o coautor
Department of Condensed Matter Physics, Faculty of Sciences, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid, Spain. - Autor o coautor
Escuela Técnica Superior de Ingenieros Industriales, Universidad Politécnica de Madrid (ETSII-UPM), Madrid, Spain diego.moreno@upm.es. - Autor o coautor
Escuela Técnica Superior de Ingenieros Industriales, Universidad Politécnica de Madrid (ETSII-UPM), Madrid, Spain. - Autor o coautor
UAM, CSIC, Ctr Biol Mol Severo Ochoa, Madrid, Spain - Autor o coautor
UCM, Dept Biol Vegetal 2, Madrid, Spain - Autor o coautor
Univ Autonoma Madrid, Dept Condensed Matter Phys, Fac Sci, Madrid, Spain - Autor o coautor
UPM, ETSII, Madrid, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

Pollen, fungi, and bacteria are the main microscopic biological entities present in outdoor air, causing allergy symptoms and disease transmission and having a significant role in atmosphere dynamics. Despite their relevance, a method for monitoring simultaneously these biological particles in metropolitan environments has not yet been developed. Here, we assessed the use of the Hirst-type spore trap to characterize the global airborne biota by high-throughput DNA sequencing, selecting regions of the 16S rRNA gene and internal transcribed spacer for the taxonomic assignment. We showed that aerobiological communities are well represented by this approach. The operational taxonomic units (OTUs) of two traps working synchronically compiled >87% of the total relative abundance for bacterial diversity collected in each sampler, >89% for fungi, and >97% for pollen. We found a good correspondence between traditional characterization by microscopy and genetic identification, obtaining more-accurate taxonomic assignments and detecting a greater diversity using the latter. We also demonstrated that DNA sequencing accurately detects differences in biodiversity between samples. We concluded that high-throughput DNA sequencing applied to aerobiological samples obtained with Hirst spore traps provides reliable results and can be easily implemented for monitoring prokaryotic and eukaryotic entities present in the air of urban areas.IMPORTANCE Detection, monitoring, and characterization of the wide diversity of biological entities present in the air are difficult tasks that require time and expertise in different disciplines. We have evaluated the use of the Hirst spore trap (an instrument broadly employed in aerobiological studies) to detect and identify these organisms by DNA-based analyses. Our results showed a consistent collection of DNA and a good concordance with traditional methods for identification, suggesting that these devices can be used as a tool for continuous monitoring of the airborne biodiversity, improving taxonomic resolution and characterization together. They are also suitable for acquiring novel DNA amplicon-based information in order to gain a better understanding of the biological particles present in a scarcely known environment such as the air.Copyright © 2017 American Society for Microbiology.

Paraules clau

AirAir microbiologyAirborne biodiversityBacteriaBioaerosol monitoringBiodiversityCitiesEukaryotaFungiHigh-throughput nucleotide sequencingHirst-type spore trapMethods in aerobiologyNext-generation sequencing (ngs)PhylogenyPollenSeasonsSpores, fungal

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Applied And Environmental Microbiology a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2017, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Food Science. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.17, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 4.03 (font consultada: Dimensions Aug 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-08-10, el següent nombre de cites:

  • WoS: 26
  • Scopus: 34
  • Europe PMC: 6

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-08-10:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 81.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 81 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 0.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (NUÑEZ HERNÁNDEZ, ANDRÉS) .

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat MORENO GOMEZ, DIEGO ALEJANDRO.