{rfName}
Di

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

1

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Rodríguez-Casillas L.Autor o coautor

Compartir

9 dejuny de 2025
Publicacions
>
Article
Hybrid Gold

Diurnal control of H3K27me1 deposition shapes expression of a subset of cell cycle and DNA damage response genes

Publicat a:Plant Journal. 120 (6): 2325-2336 - 2024-01-01 120(6), DOI: 10.1111/tpj.17114

Autors: Fung-Uceda J; Gómez MS; Rodríguez-Casillas L; González-Gil A; Gutierrez C

Afiliacions

Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa; CSIC-UAM; Nicolas Cabrera 1; Cantoblanco; Madrid; 28049; Spain - Autor o coautor

Resum

Rhythmic oscillation of biological processes helps organisms adapt their physiological responses to the most appropriate time of the day. Chromatin remodeling has been described as one of the molecular mechanisms controlling these oscillations. The importance of these changes in transcriptional activation as well as in the maintenance of heterochromatic regions has been widely demonstrated. However, little is still known on how diurnal changes can impact the global status of chromatin modifications and, hence, control gene expression. In plants, the repressive mark H3K27me1, deposited by ARABIDOPSIS TRITHORAX-RELATED PROTEIN 5 and 6 (ATXR5 and 6) methyltransferases, is largely associated with transposable elements but also covers lowly expressed genes. Here we show that this histone modification is preferentially deposited during the night. In euchromatic regions, it is found along the bodies of DNA damage response genes (DDR), where it is needed for their proper expression. The absence of H3K27me1 translates into an enhanced expression of DDR genes that follows a rhythmic oscillation pattern. This evidences a link between chromatin modifications and their synchronization with the diurnal cycle in order to accurately modulate the activation of biological processes to the most appropriate time of the day. © 2024 The Author(s). The Plant Journal published by Society for Experimental Biology and John Wiley & Sons Ltd.

Paraules clau

ActivationArabidopsisArabidopsis proteinArabidopsis proteinsAtxr5/6Cell cycleChromatinChromatin assembly and disassemblyCircadian rhythmControl systemsDamageDiurnal cycleDiurnal cyclesDna damageDna damage responseDna repairDna-repairEuchromatinFungiGene expressionGene expression regulationGene expression regulation, plantGenesGenes expressionGeneticsH3k27me1HistoneHistone lysine methyltransferaseHistone modificationHistone-lysine n-methyltransferaseHistonesMetabolismNucleic acidsOscillationPhysiological modelsPhysiologyPlant diseasesProcessesTranscription

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plant Journal a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2024 encara no hi ha indicis calculats, però el 2023, es trobava a la posició 24/273, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-08-02:

  • Scopus: 1

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-08-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 2.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 2 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 18.3.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 30 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.