{rfName}
Ro

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

60

Altmetrics

Grant support

We greatly appreciate the donation of some of the lines and constructs used: Dr Heidstra and Dr Scheres (SCZ marker and mutant lines in Col-0 background), Dr Dolf Weiers (ARF5 CDS), Dr Campilho (ahp6-1 and AHP6::GUS) and Dr Ripoll (bdl-2). This study was supported by the Spanish Government (AGL2016-75287-R to CE) and by the Castilla-La Mancha Government (SBPLY/17/180501/000287 to CE). RO was supported by an FPI grant (BES-2014-070108).

Anàlisi d'autories institucional

Del Pozo Benito, Juan CarlosAutor o coautorCabrera, JavierAutor o coautorPernas, MonicaAutor o coautorAngel Moreno-Risueno, MiguelAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

Root-knot nematodes induce gall formation by recruiting developmental pathways of post-embryonic organogenesis and regeneration to promote transient pluripotency

Publicat a:New Phytologist. 227 (1): 200-215 - 2020-07-01 227(1), DOI: 10.1111/nph.16521

Autors: Olmo, Rocio; Cabrera, Javier; Diaz-Manzano, Fernando E.; Ruiz-Ferrer, Virginia; Barcala, Marta; Ishida, Takashi; Garcia, Alejandra; Andres, Maria Fe; Ruiz-Lara, Simon; Verdugo, Isabel; Pernas, Monica; Fukaki, Hidehiro; Carlos del Pozo, Juan; Angel Moreno-Risueno, Miguel; Kyndt, Tina; Gheysen, Godelieve; Fenoll, Carmen; Sawa, Shinichiro; Escobar, Carolina;

Afiliacions

CSIC, ICA, Protecc Vegetal, Calle Serrano 115, Madrid 28006, Spain - Autor o coautor
Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, CBGP, Campus Montegancedo, Madrid 28223, Spain - Autor o coautor
Kobe Univ, Grad Sch Sci, Dept Biol, 1-1 Rokkodai, Kobe, Hyogo 6578501, Japan - Autor o coautor
Kumamoto Univ, IROAST, Kumamoto 8608555, Japan - Autor o coautor
Univ Castilla La Mancha, Area Fisiol Vegetal, Fac Ciencias Ambientales & Bioquim, Avda Carlos III S-N, Toledo 45071, Spain - Autor o coautor
Univ Ghent, Dept Mol Biotechnol, B-9000 Ghent, Belgium - Autor o coautor
Univ Talca, Inst Ciencias Biol, Lab Genom Func, Talca 3460000, Chile - Autor o coautor
Veure més

Resum

Root-knot nematodes (RKNs; Meloidogyne spp.) induce new post-embryogenic organs within the roots (galls) where they stablish and differentiate nematode feeding cells, giant cells (GCs). The developmental programmes and functional genes involved remain poorly defined. Arabidopsis root apical meristem (RAM), lateral root (LR) and callus marker lines, SHORT-ROOT/SHR, SCARECROW/SCR, SCHIZORIZA/SCZ, WUSCHEL-RELATED-HOMEOBOX-5/WOX5, AUXIN-RESPONSIVE-FACTOR-5/ARF5, ARABIDOPSIS-HISTIDINE PHOSPHOTRANSFER-PROTEIN-6/AHP6, GATA-TRANSCRIPTION FACTOR-23/GATA23 and S-PHASE-KINASE-ASSOCIATED-PROTEIN2B/SKP2B, were analysed for nematode-dependent expression. Their corresponding loss-of-function lines, including those for LR upstream regulators, SOLITARY ROOT/SLR/IAA14, BONDELOS/BDL/IAA12 and INDOLE-3-ACETIC-ACID-INDUCIBLE-28/IAA28, were tested for RKN resistance/tolerance. LR genes, for example ARF5 (key factor for root stem-cell niche regeneration), GATA23 (which specifies pluripotent founder cells) and AHP6 (cytokinin-signalling-inhibitor regulating pericycle cell-divisions orientation), show a crucial function during gall formation. RKNs do not compromise the number of founder cells or LR primordia but locally induce gall formation possibly by tuning the auxin/cytokinin balance in which AHP6 might be necessary. Key RAM marker genes were induced and functional in galls. Therefore, the activation of plant developmental programmes promoting transient-pluripotency/stemness leads to the generation of quiescent-centre and meristematic-like cell identities within the vascular cylinder of galls. Nematodes enlist developmental pathways of new organogenesis and/or root regeneration in the vascular cells of galls. This should determine meristematic cell identities with sufficient transient pluripotency for gall organogenesis.

Paraules clau
auxinscallicytokininsgall developmentlateral rootmeloidogyne spp.pluripotencyActivationArabidopsisAuxinAuxinsCalliCallus formationCytokininsF-boxGall developmentGene-expressionHeat-shockLateral rootMeloidogyne sppMeloidogyne spp.Meloidogyne-javanicaPlantPluripotencyRegenerationRoot meristemRoot meristem/regeneration

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista New Phytologist a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2020, es trobava a la posició 7/235, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.42. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 3.44 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 7.42 (font consultada: Dimensions Apr 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-04-29, el següent nombre de cites:

  • WoS: 18
  • Scopus: 42
  • OpenCitations: 43
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-04-29:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 79.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 79 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 13.7.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 25 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Belgium; Chile; Japan.