{rfName}
Pa

Indexat a

Llicència i ús

Altmetrics

Grant support

HSL gratefully acknowledges CONACYT-MEXICO for financial support (scholarship 849140). We are also thankful to DGTIC-UNAM (grant LANCAD-UNAM-DGTIC 250) for computer time. JMGV acknowledges the support of the Spanish Ministry of Science and Innovation through the Juan de la Cierva-Formation fellowship FJC2020-044053-I funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033. AMP and EF acknowledge the Spanish MICINN for financial support (grant No. PGC2018-095953-B-I00) and the FICyT (grant No. IDI-2021-000054).

Anàlisi d'autories institucional

Guevara-Vela, José ManuelAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

Partition of the electronic energy of the PM7 method via the interacting quantum atoms approach

Publicat a:Physical Chemistry Chemical Physics. 24 (32): 19521-19530 - 2022-08-03 24(32), DOI: 10.1039/d2cp02013k

Autors: Salazar-Lozas, Hugo; Guevara-Vela, Jose Manuel; Pendas, Angel Martin; Francisco, Evelio; Rocha-Rinza, Tomas

Afiliacions

MDEA Mat Inst, C Eric Kandel 2, Madrid 28906, Spain - Autor o coautor
Univ Nacl Autonoma Mexico, Inst Quim, Ciudad Univ, Ciudad De Mexico 04510, Mexico - Autor o coautor
Univ Oviedo, Dept Quim Fis & Analit, Julian Claveria 8, Oviedo 33006, Spain - Autor o coautor

Resum

Partitions of the electronic energy such as that provided by the Interacting Quantum Atoms (IQA) approach have given valuable insights for numerous chemical systems and processes. Unfortunately, this kind of analysis may involve the integration of scalar fields over very irregular volumes, a condition which leads to a large and often prohibitive computational effort. These circumstances have limited the use of these energy partitions to systems comprising a few tens of atoms at most. On the other hand, semiempirical methods have proved useful in the study of systems of several thousands of atoms. Therefore, the goal of this work is to carry out partitions of the semiempirical method PM7 in compliance with the IQA approach. For this purpose, we computed one- and two-atomic energetic contributions whose sum equals the PM7 electronic energy. We illustrate how one might exploit the partition of electronic energies computed via the PM7 method by considering small organic and inorganic molecules and the energetics of individual hydrogen bond interactions within several water clusters which include (H2O)(30), (H2O)(50) and (H2O)(100). We also considered the solvation of the amphiphilic caprylate anion to exemplify how to exploit the energy partition proposed in this paper. Overall, this investigation shows how the approach put forward herein might give further insights of the interactions occurring within complex systems in physical and biological chemistry.

Paraules clau
AtomsBiochemistryChemical processChemical systemsComputational effortConditionElectronic energiesEnergy partitionHydrogen bondsHydrogen-bondNddo approximationsOptimizationParametersQm/mmQuantum atomsScalar fieldsSemi-empirical methodsSemiempirical methodsStatesSystems and processWate

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Physical Chemistry Chemical Physics a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Physics and Astronomy (Miscellaneous).

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-05-15:

  • WoS: 1
  • Scopus: 1
  • OpenCitations: 1
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-15:

  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 4 (PlumX).
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Mexico.